पेप्सिन एक एंडोपेप्टिडेज़ है जो प्रोटीन को छोटे पेप्टाइड्स (यानी, प्रोटीज़) में तोड़ देता है। यह पेट में उत्पन्न होता है और मनुष्यों के पाचन तंत्र और कई अन्य जानवरों में मुख्य पाचन एंजाइमों में से एक है, जहां यह भोजन में प्रोटीन को पचाने में मदद करता है। पेप्सिन एक एस्पार्टिक प्रोटीज़ है, जो अपनी सक्रिय साइट में एक कैटेलिटिक एस्पार्टेट का उपयोग करता है। यह मानव पाचन तंत्र के तीन प्रमुख लक्षणों में से एक है, अन्य दो काइमोट्रिप्सिन और ट्रिप्सिन हैं। पाचन की प्रक्रिया के दौरान, ये एंजाइम, जिनमें से प्रत्येक विशेष प्रकार के अमीनो एसिड के बीच लिंक को अलग करने में विशिष्ट है, अपने घटकों, यानी पेप्टाइड्स और अमीनो एसिड में आहार प्रोटीन को तोड़ने के लिए सहयोग करते हैं, जिसे छोटी आंत द्वारा आसानी से अवशोषित किया जा सकता है। । पेप्सिन हाइड्रोफोबिक और अधिमानतः सुगंधित अमीनो एसिड जैसे फेनिलएलनिन, ट्रिप्टोफैन और टाइरोसिन के बीच पेप्टाइड बॉन्ड्स को क्लीजिंग करने में सबसे अधिक कुशल है।

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