एक पानी के अणु में तीन परमाणु होते हैं: एक ऑक्सीजन परमाणु और दो हाइड्रोजन परमाणु, जो छोटे मैग्नेट की तरह एक साथ बंधे होते हैं। परमाणुओं में पदार्थ होता है जो केंद्र में एक नाभिक होता है। परमाणुओं के बीच का अंतर परमाणु संख्याओं द्वारा व्यक्त किया जाता है। परमाणु की परमाणु संख्या परमाणु के नाभिक में प्रोटॉन की संख्या पर निर्भर करती है। प्रोटॉन छोटे धनात्मक आवेशित कण होते हैं। हाइड्रोजन के नाभिक में एक प्रोटॉन होता है और ऑक्सीजन में आठ होते हैं। नाभिक में भी अपरिवर्तित कण होते हैं, जिन्हें न्यूट्रॉन कहा जाता है।

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